Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms