Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99KU6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99KU6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99KU6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99KU6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99KU6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99KU6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99KU6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99KU6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99KU6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99KU6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99KU6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99KU6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99KU6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99KU6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99KU6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q99KU6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q99KU6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q99KU6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q99KU6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q99KU6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99KU6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99KU6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99KU6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms