Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmp1Q99KU0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmp1Q99KU0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms