Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep3Q99KK1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms