Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dok4Q99KE3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dok4Q99KE3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dok4Q99KE3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dok4Q99KE3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dok4Q99KE3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dok4Q99KE3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dok4Q99KE3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dok4Q99KE3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms