Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp11Q99K46 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp11Q99K46 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms