Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlgn1Q99K10 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms