Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms