Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim11aQ99J19 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Smim11aQ99J19 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Smim11aQ99J19 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Smim11aQ99J19 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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