Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn16Q925N4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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