Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b5Q923D4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms