Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nrif1Q923B3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrif1Q923B3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms