Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms