Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rpe65Q91ZQ5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Rpe65Q91ZQ5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Rpe65Q91ZQ5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Rpe65Q91ZQ5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Rpe65Q91ZQ5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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