Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc49Q91YK0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms