Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atl3Q91YH5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms