Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms