Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx15Q91WE1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx15Q91WE1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms