Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms