Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms