Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms