Protein–RNA interactions for Protein: Q8VGL0

Olfr340, Olfactory receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Olfr340Q8VGL0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Olfr340Q8VGL0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Olfr340Q8VGL0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Olfr340Q8VGL0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Olfr340Q8VGL0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Olfr340Q8VGL0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Olfr340Q8VGL0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Olfr340Q8VGL0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Olfr340Q8VGL0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Olfr340Q8VGL0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Olfr340Q8VGL0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Olfr340Q8VGL0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Olfr340Q8VGL0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Olfr340Q8VGL0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Olfr340Q8VGL0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Olfr340Q8VGL0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Olfr340Q8VGL0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Olfr340Q8VGL0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Olfr340Q8VGL0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Olfr340Q8VGL0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Olfr340Q8VGL0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Olfr340Q8VGL0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Olfr340Q8VGL0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Olfr340Q8VGL0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Olfr340Q8VGL0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Olfr340Q8VGL0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Olfr340Q8VGL0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Olfr340Q8VGL0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Olfr340Q8VGL0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms