Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps4aQ8VEJ9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms