Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk4Q8VEJ3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk4Q8VEJ3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms