Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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Smg8Q8VE18 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Smg8Q8VE18 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Smg8Q8VE18 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Smg8Q8VE18 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Smg8Q8VE18 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Smg8Q8VE18 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms