Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh10Q8VCH7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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