Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms