Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms