Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms