Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZZ8

Rab38, Ras-related protein Rab-38, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab38Q8QZZ8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab38Q8QZZ8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms