Protein–RNA interactions for Protein: Q8K572

Hus1b, Checkpoint protein HUS1B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hus1bQ8K572 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hus1bQ8K572 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hus1bQ8K572 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms