Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J2

Ebf4, Transcription factor COE4, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf4Q8K4J2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms