Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Rdh16f2Q8K3M1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rdh16f2Q8K3M1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rdh16f2Q8K3M1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rdh16f2Q8K3M1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rdh16f2Q8K3M1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rdh16f2Q8K3M1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rdh16f2Q8K3M1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rdh16f2Q8K3M1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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