Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms