Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sash3Q8K352 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sash3Q8K352 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms