Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nsl1Q8K305 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms