Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ncapd2Q8K2Z4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms