Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Paf1Q8K2T8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paf1Q8K2T8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms