Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms