Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1eQ8K202 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms