Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms