Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot3Q8K0V4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot3Q8K0V4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms