Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a11Q8K0E3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a11Q8K0E3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a11Q8K0E3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a11Q8K0E3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a11Q8K0E3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a11Q8K0E3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a11Q8K0E3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a11Q8K0E3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a11Q8K0E3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc5a11Q8K0E3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc5a11Q8K0E3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc5a11Q8K0E3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc5a11Q8K0E3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms