Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbrd1Q8K0B2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms