Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pnma3Q8JZW8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnma3Q8JZW8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms