Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CopaQ8CIE6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms