Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms