Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcerg1Q8CGF7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms