Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Hpf1Q8CFE2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hpf1Q8CFE2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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