Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ercc8Q8CFD5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ercc8Q8CFD5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ercc8Q8CFD5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ercc8Q8CFD5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ercc8Q8CFD5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ercc8Q8CFD5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ercc8Q8CFD5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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